Dentysta Kraków
Stomatologia i dentystyka w Krakowie

Izolacja nowego koronawirusa od człowieka z zapaleniem płuc w Arabii Saudyjskiej AD 6

Posted in Uncategorized  by admin
September 1st, 2019

Drzewo o największej wiarygodności zostało zbudowane, aby wywnioskować zależności filogenetyczne (rysunek 2B). To drzewo filogenetyczne wykazało, że HCoV-EMC należy do linii C z rodzaju betakoronawirusa, a także koronawirusów nietoperzy HKU4 i HKU5. Rodzaj betakoronawirusa zawiera trzy dodatkowe linie; A, B i D.1 HCoV-HKU1 i HCoV-OC43 należą do linii A, podczas gdy SARS-CoV należy do linii B. Linia D nie zawiera żadnych ludzkich patogenów i jest reprezentowana w drzewie przez koronawirus Rousettus bat HKU9. Zatem HCoV-EMC różni się od wcześniej znanych ludzkich koronawirusów. HCoV-NL63 i HCoV-229E są jeszcze bardziej odróżnione od HCoV-EMC, ponieważ te dwa ludzkie patogeny należą do innego rodzaju, alfakoronawirusa (Figura 2B). W celu dalszego scharakteryzowania wirusa około 90% sekwencji genomu wirusa uzyskano podczas analizy sekwencji przy użyciu platformy 454. Następnie zaprojektowane zostały specyficzne startery do amplifikacji zachodzących na siebie fragmentów PCR o wielkości około 800 bp dla konwencjonalnego sekwencjonowania Sangera. Uzyskano sekwencję o prawie pełnej długości (numer dostępu GenBank, JX869059), dla której ostateczna adnotacja była w toku w czasie tego raportu. Genom wirusa HCoV-EMC koduje otwarte ramki odczytu wspólne dla betakoronawirusów, w tym otwartą ramkę odczytu 1ab, która koduje wiele produktów enzymatycznych, glikoproteinę powierzchniową (S), białko o małej kopercie (E), matrycę (M). białko i białko nukleokapsydu (N), a także kilka genów niestrukturalnych. Genom nie koduje białka esterazy hemaglutyninowej, w przeciwieństwie do innych betakoronawirusów.
Porównaliśmy produkt genu Iab otwartej ramki odczytu HCoV-EMC z tymi z innych betakoronawirusów, HKU4 i HKU5, aby sprawdzić, czy HCoV-EMC może należeć do jednego z tych znanych gatunków lub czy reprezentuje nowy gatunek w obrębie rodzaju. Międzynarodowy Komitet ds. Taksonomii (ICTV) uważa, że wirusy, które mają ponad 90% identyczności sekwencji w konserwatywnych domenach repliki, należą do tego samego gatunku.1 Ten próg 90% tożsamości służy jako jedyne kryterium demarkacyjne. Ponieważ tożsamość sekwencji aminokwasowych w tych zachowanych domenach otwartej ramki odczytu 1ab pomiędzy HCoV-EMC i HKU4 i HKU5 była mniejsza niż 80%, doszliśmy do wniosku, że HCoV-EMC reprezentuje nowy gatunek betakoronawirusa, chociaż taka klasyfikacja wymaga formalnego zatwierdzenia przez ICTV.
Dyskusja
W pierwszej dekadzie XXI wieku zaobserwowano wzrost liczby koronawirusów, które zidentyfikowano wraz z odpowiednim wzrostem liczby genomów koronawirusów, które zostały zsekwencjonowane. Wzrost ten był spowodowany odkryciem koronawirusa SARS, który doprowadził do globalnego wybuchu zapalenia płuc w 2003 r., Które dotknęło osoby w około 30 krajach i doprowadziło do około 800 zgonów12. Przed 2003 r. Znane były tylko dwa ludzkie koronawirusy, HCoV-229E i HCoV-OC43, oba odkryte w latach 1960. 13,14 Po pojawieniu się SARS-CoV w 2003 r. odkryto dwa dodatkowe ludzkie koronawirusy, HCoV-NL63 i HCoV-HKU1.15-17. Tutaj opisujemy izolację i charakterystykę szóstego koronawirusa, który najwyraźniej może zarażać ludzi.
Na podstawie danych genetycznych, ICTV zidentyfikował cztery klastry wirusów w podrodziny Coronavirinae, z których trzy reprezentują zatwierdzone rodzaje; alfakoronawirus, betakoronawirus i gammakoronawirus
[więcej w: playernotes wot, kękę nowe rzeczy chomikuj, gemini tarnów ]

Tags: , ,

No Responses to “Izolacja nowego koronawirusa od człowieka z zapaleniem płuc w Arabii Saudyjskiej AD 6”

  1. Konstanty Says:

    leczenie raka jądra polega na jego usunięciu

  2. The Dude Says:

    [..] Blog oznaczyl uzycie nastepujacego fragmentu metanabol bałkan[...]

  3. Aurelia Says:

    Mają nowoczesny sprzęt co również jest ważne wykonując takie badanie

  4. Stacker of Wheat Says:

    [..] Artukul zawiera odniesienia do tresci: trenabol[...]

  5. Łukasz Says:

    Dwa miesiące temu miałam zapalenie oskrzeli.

  6. Melania Says:

    [..] Odniesienie w tekscie do katowice restauracja[...]

  7. Cabbie Says:

    Witam. Niedoczynność mam od urodzenia

Powiązane tematy z artykułem: gemini tarnów kękę nowe rzeczy chomikuj playernotes wot